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打造高效工作环境之终端篇
想发高分Paper吗?想迅速找到新Gene吗?想筛到目标Marker吗?想迎娶白富美(小鲜肉)吗?来来来,学点生信知识吧。
学生信,第一步干啥呢,在Linux中游一圈吧。为啥要是Linux,别告诉我你还不知... READ MORE > -
关于debug,Perl命令行调试器了解一下
相信每个程序猿都有过编程5分钟,查问题N小时的经历,也许你觉得通过打印日志可以查到问题,但是这样一方面日志会对代码有侵入,一方面当日志量较大,比如需要跟进循环内部时,很难排查出有问题的是哪条。今... READ MORE > -
多重关联分析工具HallA
HallA(Hierarchical All-against-All association)是一个分析多维度、异质性数据的多重关联分析工具,在微生物研究中,它是可用于转录组与宏基因组关联分析的一个重要工具。今天我们就来具体学习下这款... READ MORE > -
几种维恩图的绘制方法
无论是二代测序还是芯片分析,在检测到基因后,您也许想知道哪些基因是受测样本共有的,哪些是样本独有的,这时最简单的就是采用维恩图分析,这里介绍几种维恩图的绘制方法。 READ MORE > -
还不会绘制好看的Circos热图?快来了解一下
Circos圈图起初是为了基因组序列相关数据的可视化,比如甲基化,组蛋白修饰,snp等。现在Circos可以实现大多数关系型数据的可视化,可以应用于各个领域。
Circos有多种方式来展示各类数据,如使用直方... READ MORE > -
绘制热图也可以如此简单
在阅读文件的过程中,大家肯定会时常看到热图(Heatmap)。热图不仅好看,而且还能直观地表达分析结果,在文章中有不可或缺的地位。比如,下图: READ MORE > -
多重假设检验在宏基因组研究领域的应用
目前,在宏基因组学研究领域,很多研究人员会通过非参数检验来找出有显著性差异的物种。通常,物种间是否具有显著性差异,一般会通过比较P值与P值阈值来判断。 READ MORE >