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R中par()函数的参数详解
R语言中par()函数是画图中专门用来设置参数的函数,它可以用来设置或者获取图形参数。
par()本身(括号中不写任何参数)表示返回当前的图形参数设置(一个list);若要设置图形参数,则可用par(tag = ... READ MORE > -
图形修改之ImageMagick篇
ImageMagick (TM) 是一个免费创建、编辑、合成图片的软件,可在多种操作系统下进行操作。 它可以读取和写入各种格式的图像(超过200种),包括PNG,JPEG,GIF,HEIC,TIFF,DPX,EXR,WebP,Postscript,... READ MORE > -
Venn图后续
Venn图可以展示多个样本/分组某种属性共有和特有的部分,如OTU,基因等。由此可以观察样本/分组的相似程度。在R语言中有很多拓展包可以画Venn图,使用方法大致相同,下面介绍一下用VennDiagram包画venn图。 READ MORE > -
高大上的绘图系统ggplot2
ggplot2是一个基于图形语法的声明式创建图形的系统;使用ggplot2绘图的过程就像是使用动词、名词、形容词等按照语法来进行创造句子的过程。绘图的本质是将数据映射到几何客体(点/线/条等)的美学属性上(... READ MORE > -
awk随笔
awk是linux下一款强大的文本处理工具,今天就带大家来了解一下它的一些简单功能。当然如果大家遇到的是一些较为复杂的问题,还是得考虑用脚本来解决问题。 READ MORE > -
Kraken进行宏基因组分类分析
Kraken是2013年9月推出的一款宏基因组分类分析软件,通过使用k-mers的精确对齐和新的分类算法来实现高灵敏度、高速度的分析。
与MetaPhalAn2相比Kraken的特点是非常快速,但内存需求较大,比较适宜大... READ MORE > -
使用Matplotlib绘制图像
Matplotlib是一个Python的2D绘图库,它以各种硬拷贝格式和跨平台的交互式环境生成出版质量级别的图形。通过Matplotlib,开发者可以仅需要几行代码,便可以生成绘图,直方图,功率谱,条形图,错误图,散点... READ MORE >