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绘制炫酷桑基图,R语言(networkD3包)能搞定?
桑基图(Sankey)是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,其最明显的特征就是,始末端的分支宽度相等,即所有主支宽度的总和应与所有分出去的分支宽度的总和相等,保持能量的平衡... READ MORE > -
多分组热图不用愁,Pheatmap来帮忙
热图作为实验数据分布情况的直观展示方法,已经成为高分文章的不错选择,它不仅可以对数据质量进行具像化展示,还可以对数据和样品进行聚类。在R中有多个包均可绘制热图,今天小锐给大家介绍一个可以绘制多... READ MORE > -
基因编辑技术再次“火”了,而这一次,研究者却受到了122位科学家的强烈谴责!
上一次基因编辑领域爆出重大新闻,是2017年的8月份。当时,师从“合成生物学之父”--美国科学院与工程学院双院士George Church教授的杨璐菡博士,带领她的团队使用CRISPR-Cas9基因编辑技术,成功解决了猪... READ MORE > -
ROC,解决数据不均衡时的模型评价问题
通常评价一个模型好坏的方式有很多种,准确率(Accuracy)就是其中之一,但是两类数据不均衡的时候,会导致准确率看起来不低,但实际模型的效果并不好,而ROC曲线(Receiver Operating Characteristic cu... READ MORE > -
新型感冒药,真正能阻断感冒病毒的新分子
说到常见疾病,首当其冲应该就是感冒了,讨厌的感冒病毒真的让地球人防不慎防,一不小心就“中招”。 READ MORE > -
多靶点粪便DNA检测,为炎症性肠病患者添保障
IBD主要包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)。目前普遍认为,IBD是携带遗传易感基因的宿主在环境因素参与下,由于慢性肠道感染、黏膜抗原屏障缺陷以及肠腔内抗原物质的异常免疫反应所导致,起病慢,病... READ MORE > -
疾病进展标志物差异分析之Jonckheere-Terpstra检验
例如:结直肠癌有四个发展阶段,分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个发展阶段,假设我们手中有四个阶段的结直肠癌的样本,需要通过这些样本得知在结直肠癌整个发展阶段中哪些肠道中菌的含量是随着癌症的恶化逐步增加或... READ MORE >