宏基因组测序

宏基因组测序,是指利用高通量测序技术,以某一特定环境中微生物的基因组为研究对象,使用生物信息学的分析方法,研究微生物的多样性、微生物的群落结构,探索微生物的潜在功能以及与环境之间的互作关系。与传统的微生物组研究方法相比,宏基因组测序技术突破了有些微生物不可培养的瓶颈,能够快速高效的获取整个微生物群落的基因组信息,因此近年来该技术在各种环境微生物学研究中得到了广泛应用。

测序平台与策略

采用Illumina HiSeq测序平台,PE150的测序策略。

技术线路
分析内容及分析图展示(部分)

信息分析内容

一、数据质控和组装

二、物种注释与差异物种分析

三、基因集构建与差异基因分析

四、功能注释分析

五、高级分析

  • KEGG代谢通路可视化分析

  • MGS丰度热图

  • CAG中基因丰度热图

  • KEGG注释结果分类统计

技术优势
  • 项目经验丰富

    文章产出量高

  • 实验技术成熟

    分析方法合理

  • 分析内容全面

    紧跟国际研究前沿

  • 图片展示精美

    备受主流期刊青睐

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