16S/ITS等扩增子测序

 16S rDNA是细菌编码16S rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中。该基因序列足够长(包含约50个功能域),且具有高度的保守性和特异性。16s rDNA微生物多样性测序基于可变区序列进行测序,主要用于鉴定环境中的微生物多样性和微生物群落组成。
在真核生物基因中,18S rDNA和28S rDNA基因间隔序列称为(ITS),位于18S和5.8S之间的为ITS1区,位于5.8S和28S之间的为ITS2区。核糖体DNA中的18S、5.8S和28S的基因组序列在大多数生物中趋于保守,在生物种间变化小,而内转录间隔区ITS1和ITS2作为非编码区,承受的选择压力较小,相对变化较大,可用于真菌分类鉴定

测序平台与策略

采用Illumina HiSeq 2500测序平台,PE250的测序策略。

技术线路
分析内容及分析图展示(部分)

信息分析内容

一、物种注释与评估

二、物种分类与丰度分析

三、Alpha多样性分析

四、Beta多样性分析

五、显著性差异分析

六、高级分析

七、个性化分析

  • 关联分析

  • 丰度前30的物种相关性分析

  • 差异OTUs的Boxplot

  • LefSe分析

技术优势
  • 项目经验丰富

    文章产出量高

  • 实验技术成熟

    分析方法合理

  • 分析内容全面

    紧跟国际研究前沿

  • 图片展示精美

    备受主流期刊青睐