16S/ITS等扩增子测序

16S rRNA基因存在于所有细菌的基因组中,是细菌编码rRNA相对应的DNA序列,其高度的保守性和特异性是细菌进化的“分子尺标”。16S rDNA测序是指对环境样品中的16S rRNA基因高变区进行PCR扩增及高通量测序的一种技术,广泛应用于样本中微生物群落的快速鉴定。

测序平台与策略

采用Illumina测序平台,PE250的测序策略

技术线路
分析内容及分析图展示(部分)

16S rRNA基因存在于所有细菌的基因组中,是细菌编码rRNA相对应的DNA序列,其高度的保守性和特异性是细菌进化的“分子尺标”。16S rDNA测序是指对环境样品中的16S rRNA基因高变区进行PCR扩增及高通量测序的一种技术,广泛应用于样本中微生物群落的快速鉴定。

在真核生物rDNA中,18S rDNA和28S rDNA转录间隔序列称为ITS,位于18S和5.8S之间的为ITS1区,位于5.8S和28S之间的为ITS2区。18S、5.8S和28S的基因序列在大多数生物中趋于保守,物种间变化小,而转录间隔区ITS1和ITS2作为非转录区,在进化过程中承受的自然选择压力较小,能容忍更多的变异,在绝大多数的真核生物中表现出了极为广泛的序列多态性,可用于真菌分类鉴定。

 

  • 关联分析

  • 丰度前30的物种相关性分析

  • 差异OTUs的Boxplot

  • LefSe分析

技术优势
  • 项目经验丰富

    文章产出量高

  • 实验技术成熟

    分析方法合理

  • 分析内容全面

    紧跟国际研究前沿

  • 图片展示精美

    备受主流期刊青睐