16S rDNA是细菌编码16S rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中。该基因序列足够长(包含约50个功能域),且具有高度的保守性和特异性。16s rDNA微生物多样性测序基于可变区序列进行测序,主要用于鉴定环境中的微生物多样性和微生物群落组成。
在真核生物基因中,18S rDNA和28S rDNA基因间隔序列称为(ITS),位于18S和5.8S之间的为ITS1区,位于5.8S和28S之间的为ITS2区。核糖体DNA中的18S、5.8S和28S的基因组序列在大多数生物中趋于保守,在生物种间变化小,而内转录间隔区ITS1和ITS2作为非编码区,承受的选择压力较小,相对变化较大,可用于真菌分类鉴定


采用Illumina HiSeq 2500测序平台,PE250的测序策略。



信息分析内容 |
一、物种注释与评估 |
二、物种分类与丰度分析 |
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三、Alpha多样性分析 |
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四、Beta多样性分析 |
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五、显著性差异分析 |
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六、高级分析 |
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七、个性化分析 |
关联分析
丰度前30的物种相关性分析
差异OTUs的Boxplot
LefSe分析

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