宏转录组测序

宏转录组测序指从整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段;它以生态环境中的全部RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。相较于宏基因组,宏转录组能从转录水平研究复杂微生物群落变化,更好地挖掘潜在的新基因。

测序平台与策略

采用Illumina测序平台,PE150的测序策略

技术路线
生物信息分析流程及部分结果展示

生物信息分析流程

  差异基因火山图  物种组成PCoA图

                                                                                                                    

     KEGG注释结果分类统计      差异KO分析展示

                                                                                 

应用领域

宏转录组测序技术可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能,还可以比较不同环境下的差异基因表达情况和差异功能,揭示微生物在不同环境压力下的适应机制,探索环境与微生物之间的互作机理。此产品目前已广泛应用于以下领域:

1. 医药领域:人体微生物与疾病关系的研究、分子标志和药物靶点的筛选鉴定等;

2. 生态领域:根际微生物与植物等生物互作、微生物制剂的开发、生物代谢调控研究等;

3. 工业领域:酿酒/发酵过程中活性微生物功能改变、微生物活性物质开发、生物能源、环境污染监控与生物修复等。