2019-09-17浏览量:488

在线数据可视化系列一:维恩图

维恩图

 

维恩图(Venn),也叫温氏图、韦恩图、范氏图,用于显示元素集合重叠区域的图表。韦恩图是关系型图表,通过图形与图形之间的层叠关系,来表示集合与集合之间的相交关系。

在微生物的研究中,可根据每个样品的OTU/gene/species在每个样品的丰度,计算出每个样品或组间共有和特有的OTU/gene/species,然后绘制维恩图展示。

 

在之前的《几种维恩图的绘制方法》已经为大家分享过以下几种方式绘制维恩图:

1. 在线网址http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

2. VennPainter软件

3. R包VennDiagram

其中,在线绘制的方法非常简单、方便。这一期,我们总结总结都有哪些在线网站可以绘制,又各自有什么特点。

 

一  在线绘制VENN-1

◼ 推荐指数:★

◼ 网址:

http://www.biovenn.nl/index.php

◼ 特点:

    ⏩ 2~3元

    ⏩ 文件上传、在线填写

    ⏩ 丰富的参数设置

    ⏩ 另存为svg、png格式结果

二  在线绘制VENN-2

◼ 推荐指数:★

◼ 网址:

http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn4.cgi

◼ 特点:

    ⏩ 2~4元

    ⏩ 在线填写集合内容

    ⏩ 另存为gif格式结果

三  在线绘制VENN-3 

◼ 推荐指数:★★

◼ 网址:

https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

◼ 特点:

    ⏩ 2~4元

    ⏩ 在线填写集合内容

    ⏩ 可简单设置颜色、线条、字体

    ⏩ 另存为png格式结果

四  在线绘制VENN-4

 ◼ 推荐指数:★★★

◼ 网址:

http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

◼ 特点:

    ⏩ 2~5元

    ⏩ 文件上传、在线填写

    ⏩ 丰富的统计信息

    ⏩ 下载svg、png格式结果

五  在线绘制VENN-5 

◼ 推荐指数:★★★★

◼ 网址:

http://www.interactivenn.net/

◼ 特点:

    ⏩ 2~6元

    ⏩ 文件上传、在线填写

    ⏩ 可设置颜色、字体大小、图片透明度

    ⏩ 下载svg、png格式结果

六  在线绘制VENN-6

 ◼ 推荐指数:★★★★★

◼ 网址:

http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html

◼ 特点:

    ⏩ 2~6元

    ⏩ 文件上传、在线填写

    ⏩ 丰富的参数设置

    ⏩ 下载svg、png格式结果

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