2019-05-15浏览量:377

微生物研究必备:Cytoscape绘制网络图(四)

 

——Cytoscape软件已开讲三堂课啦,还想再了解其他哪方面的干货呢?

——给我们讲讲网络图中线属性设置方法吧~

 

 

Cytoscape是一个专用于互作网络数据可视化的软件。上几次,我们介绍了Cytoscape软件下载和安装数据导入技巧节点属性设置方法。接下来,我们介绍网络图中线属性设置方法

 

一、常见线属性

常见的线属性:主要是线的类型、颜色、粗细等。通过已经导入的线文件,进行线的个性化的设置,依次单击Style、Edge进行设置即可。常见的线属性(在Properties下面三个词:Def表示默认设置,Map表示全局设置,Byp表示个性化设置。通过这3列设置项,可以实现更多个性化设置。)如下:

 

 

二、线类型设置

♦ 利用线文件中的v4列(即正相关用1表示,负相关用-1)设置不同类型

♦ Column选择v4列

♦ Mapping Type选择Discrete Mapping,负相关设置虚线,正相关设置实线

 

 

三、线颜色设置

♥ 利用线文件中的v4列设置不同颜色

♥ Column选择v4列

♥ Mapping Type选择Discrete Mapping,负相关设置红色

 

 

四、 线粗细设置

▶ 利用线文件中的r列(即相关性的大小)设置粗细,表示相关性的强弱

▶ Column选择r列

▶ Mapping Type选择Continuous Mapping

▶ 单击Current Mapping设置合适的最大最小

 

 

掌握线属性设置方法,

动手绘制出精美网络图!

更多实用技巧,请看下回分享!


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