2018-11-15浏览量:168

人体宏基因组测序分析产品闪亮登场

MetaPhlAn2与Humann2是全球知名的哈佛大学Huttenhower实验室开发的专门针对人体各个部位宏基因组测序结果进行分析的软件。锐翌基因结合多年人体微生物的项目经验,紧跟国际科研前沿,积极开发了MetaPhlAn2与Humann2结合的宏基因组测序分析产品,旨在为客户提供更优质的科研服务,助力客户文章产出。

产品介绍

MetaPhlAn2物种注释数据库源于HMP(Human microbiome project),基于17000多个参考基因组(13500个细菌和古生菌,3500个病毒和110个真核生物)中鉴定出的1M特异性标记基因(marker基因)进行物种注释,分析目标样本中微生物群落(细菌、古菌、真核生物和病毒)的组成。此外,MetaPhlAn2新添加StrainPhlAn模块,使物种鉴定水平可以到菌株水平。

Humann2,The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2,该分析依赖于MetaPhlAn2的物种注释结果,准确有效地获得微生物对应代谢途径的信息,可以回答微生物群体可能在做什么。

 产品优势

(1)物种比对数据库源于HMP,具有权威性;

(2)物种比对数据库综合了人体各个部位物种的组成,该款分析适用于人体各个部位的宏基因组测序分析;

(3)物种比对基于marker基因,比对准确率高,比对效率高;

(4)物种比对结果的精度高,有部分可以推测到菌株水平;

(5)Humann2准确定位物种对功能的贡献。

产品研究领域

人体各个部位,包括人粪便、皮肤、口腔等

部分结果展示

物种/功能组成多样性                        物种互作网络分析

                                                                                                                                               差异分析

疾病诊断模型

人体不同部位微生物的硝酸还原代谢

经典文献应用案例

Strains, functions and dynamics in the expanded Human Microbiome Project

发表期刊:Nature   影响因子:40.137   

发表时间:2017

HMP第二期计划,文中来自265人的1631个样本进行了宏基因组测序。“关于哪些微生物和分子过程有助于维持人类微生物组的健康,这项研究提供了迄今为止最详细的信息。”

人体不同部位微生物的核心和差异功能组成

Infant diet and maternal gestational weight gain predict early metabolic maturation of gut microbiomes

发表期刊:Nature Medicine   IF : 32.621

发表时间:2018

肠道共生微生物可抵抗病原菌、获取营养和免疫识别的功能,从而预防或调节多种人类相关的疾病。了解早期微生物组建立的影响因素可以指导健康、促进疾病的预防工作。

婴儿配方奶粉设计的初衷不仅是在营养上模拟母乳,还能在婴儿肠道中培养对于维持健康不可或缺的类似微生物群,但是配方奶粉影响肠道菌群的机制上不清楚,本研究基于402个0~8月的婴儿粪便进行配方奶粉、生成方式对肠道菌群影响的研究。

婴儿微生物组成

 (锐翌合作客户文章)

Initial meconium microbiome in Chinese neonates delivered naturally or by cesarean section

发表期刊:Scientific Reports   IF : 4.259

发表时间:2018

已有研究报道自然分娩和剖宫产影响胎儿微生物组成。分娩方式对胎儿生命第一天的微生物组成重要性尚不清楚,而这个阶段主要受喂养的影响。使用宏基因组测序研究顺产和剖宫产分娩婴儿出生后第一个24小时内的粪便菌群,使用MetaPhlAn2与Humann2对物种和功能进行分析。


不同分娩方式婴儿胎便优势微生物的相关性

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